Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TCF20Q9UGU0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TCF20Q9UGU0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF20Q9UGU0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms