Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP35Q9P2H5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP35Q9P2H5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms