Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMG20BQ9P0W2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HMG20BQ9P0W2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms