Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NKIRAS2Q9NYR9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKIRAS2Q9NYR9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms