Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms