Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MTMR4Q9NYA4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTMR4Q9NYA4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms