Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM161AQ9NX61 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM161AQ9NX61 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms