Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARVAQ9NVD7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARVAQ9NVD7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms