Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms