Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF275Q9NSD4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF275Q9NSD4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms