Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KRT84Q9NSB2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRT84Q9NSB2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms