Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SERINC1Q9NRX5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms