Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEC31BQ9NQW1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEC31BQ9NQW1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms