Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ASCL3Q9NQ33 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms