Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRC4Q9NPP4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NLRC4Q9NPP4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms