Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CABP2Q9NPB3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CABP2Q9NPB3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CABP2Q9NPB3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms