Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJC4Q9NNZ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms