Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRMS1Q9HCU9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms