Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM8AQ9HCN3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms