Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KIAA1549Q9HCM3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KIAA1549Q9HCM3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms