Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD3Q9H7E2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms