Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
KCNQ1DNQ9H478 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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