Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC8Q9H0W5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC8Q9H0W5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms