Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR88Q9GZN0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms