Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMBRA1Q9C0C7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms