Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM5Q9C035 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM5Q9C035 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms