Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRRTQ9BXP5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRRTQ9BXP5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms