Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TSEN34Q9BSV6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms