Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGIP1Q9BQI5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms