Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GAL3ST1Q99999 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GAL3ST1Q99999 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms