Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHP1Q99653 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHP1Q99653 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms