Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDCA3Q99618 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDCA3Q99618 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms