Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SCAF11Q99590 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCAF11Q99590 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms