Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP88Q99567 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP88Q99567 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP88Q99567 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP88Q99567 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP88Q99567 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP88Q99567 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms