Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC5LQ99459 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC5LQ99459 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms