Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SIN3AQ96ST3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SIN3AQ96ST3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms