Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DCLRE1CQ96SD1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms