Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIGSQ96S52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIGSQ96S52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms