Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ALS2Q96Q42 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALS2Q96Q42 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms