Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNMA5Q96PV4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms