Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCLT1Q96NL6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms