Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF396Q96N95 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF396Q96N95 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms