Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
COG8Q96MW5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms