Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCMTD1Q96MG8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCMTD1Q96MG8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms