Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF4

CCDC140, Coiled-coil domain-containing protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC140Q96MF4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC140Q96MF4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC140Q96MF4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms