Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CEP295NLQ96MC4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CEP295NLQ96MC4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms