Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00208Q96KT6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms