Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CELF6Q96J87 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CELF6Q96J87 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms