Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED3Q96IU2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED3Q96IU2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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