Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAX2Q96IS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAX2Q96IS3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms